以下建議非必須，但按此操作可得到更佳測量效果：
1、測量前將樣品中度混勻（可采用震蕩器或用手指彈震管底）。
2、TIP頭插入液面下吸取樣品，可避免吸入氣泡；TIP頭貼著下光纖表面打出樣品，且只按到移液器第一擋盡頭，第二擋不要按，可以避免吹出氣泡到樣品中。
3、每次測量完畢后，用蒸餾水清潔上下光纖端面，這樣可以更好地保證下一次測量的準確性（主要針對超高濃度樣品，一般樣品無此要求）。
4、每次做BLANK前一定要先用水清潔上下光纖表面，可保證BLANK準確。
5、每次測量的核酸樣品量建議為1.5-2微升,蛋白樣品建議2-2.5ul. 過少可能無法形成水柱，過多可能溢出。
6、加樣后盡快測量，以防蒸發濃縮以及灰塵落入，已加樣品不能多次MEASURE,如需重測需重新滴加同一樣品。
7、儀器避免陽光直射，避免強風吹拂，以避免蒸發。
8、連續測量一段時間后擦凈樣品，用水清潔上下光纖表面，然后用水或BUFFER做RE-BLANK后再MEASURE
9、儀器不用時，將上臂放下，可以防止灰塵。
10、清潔上下光纖表面的方法是：用移液器加2-2.5ul水在下光纖表面，放下上臂，并順便按壓一下上臂，以使下光纖表面的水滴碰到上光纖表面（ND2000不需要按），然后將上下表面的水都用吸水紙擦去即可。清除樣品時同樣是要將上下表面都擦去。
